CST Tech Tips - ChIP酶解法的超声处理

825 人阅读发布时间：2020-07-29 16:31

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CST ChIP 实验的染色质片段化有两种方法，一种是超声法，另一种是酶解法。无论您采用的是超声法还是酶解法，均需要对样品进行超声处理，超声可以促进细胞和胞核的裂解，以及染色质的片段化。以下视频将涵盖酶解法中的超声处理步骤。

温馨提示：您可以选择观看上方视频，或直接阅读下方的文字，二选一，两种方式花费时长均约3分钟。

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尽管已经使用酶解法进行染色质片段化，但这仍需一个简短的超声处理步骤来打开膜，然后释放染色质。如果您只用超声法进行 ChIP 实验，请参考之前的文章，因为对于这种情况，其超声处理更为严苛。

酶解法和超声法的超声步骤有一些通用要求。首先，在超声处理周期期间或间隔，要始终把样本放在冰上，避免样本变热。其次，将超声仪探针的针尖插入到试管的底部，并调整超声仪设置，如波幅，以免超声处理期间出现气泡。否则，您的靶蛋白可能会变性， ChIP 信号会丢失。

那么，针对酶解法，超声处理有一些特殊的地方。因为染色质已被微球菌核酸酶片段化，所以仅需稍作超声处理便可释放染色质片段。如果使用 0.5 mL 样本进行超声处理，预计离心处理后的样本后，不溶物质的沉淀物非常小。如果观察到沉淀物较大——大约达 10 μl 或以上（如下图），那么这说明胞核依然完整，您应该对样本进行进一步超声处理。

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